rails + passengerでbasic認証

こんな感じでを追加してあげればOK。
LocationディレクティブはDirectoryディレクティブとは違ってウェブ空間に対する設定を行うので、/adminとか相対URLで指定できると。

<VirtualHost *:80>
        ServerAdmin webmaster@localhost
        ServerName xx.xxx.xxx.xxx
        ServerAlias xx.xxx.xxx.xxx
        DocumentRoot /var/www/myapp/current/public
        <Directory /var/www/myapp/current/public>
                Options FollowSymLinks -MultiViews
                AllowOverride All
                Order allow,deny
                allow from all
        </Directory>
        <Location /admin>
                AuthUserFile /home/somebody/.htpasswd
                AuthGroupFile /dev/null
                AuthName "Please enter your ID and password"
                AuthType Basic
                require valid-user
        </Location>
</VirtualHost>

.htpasswdの場所はホームディレクトリ以外がいいような…。

こちらを参考にしました！
Slicehost Forum - Passenger and htaccess, multiple login prompts